Kraj Vysočina leží v centrální části České republiky. Jeho územím procházejí významné komunikace spojující Prahu a další aglomerace v Čechách s moravskými aglomeracemi. Územím prochází nejkratší spojení Prahy a Brna jako center dvou největších koncentrací obyvatelstva, výroby a služeb ve státě. Dopravní koridor, probíhající územím ve směru severozápad – jihovýchod, je součástí jedné z nejvýznamnějších urbanizačních os Evropy, spojujících Skandinávii přes Berlín, Vídeň a Budapešť s jihovýchodní Evropou a Malou Asií.
Kraj Vysočina sousedí se čtyřmi kraji ČR: Jihočeským, Středočeským, Pardubickým a Jihomoravským. Spolu s Jihomoravským krajem tvoří region soudržnosti Jihovýchod. Centrální polohu regionu v ČR vyjadřuje i to, že spolu se Středočeským krajem (a Prahou) je jediným krajem ČR, který neleží na státní hranici. V jižní části se však kraj přibližuje na vzdálenost 5km hranicím Rakouska, což vysvětluje zájem subjektů z Vysočiny o přeshraniční spolupráci.
Název kraje „Vysočina“ je odvozen od tradičního označení krajiny Českomoravské vrchoviny. Území se nachází ve vyšší nadmořské výšce (Jihlava je nejvýše položeným krajským městem ČR) a je pro něj typická pestrá kulturní krajina, představovaná mozaikou lesů, polí, luk, vodních ploch a menších sídel, s množstvím symbolicky významných míst. V kontextu střední Evropy má území Vysočiny vysokou environmentální hodnotu.
Tranzitní poloha kraje na vrchovinném území mezi českou a moravskou sídelní oblastí je symbolicky vyjádřena také průběhem historické zemské hranice Čech a Moravy, procházející nejen napříč krajem, ale i krajským městem.
Kraj Vysočina leží na hlavním evropském rozvodí mezi Severním a Černým mořem a je významnou pramennou oblastí. Do Labe odvádí vodu Sázava, Želivka, Doubrava, Chrudimka a Nežárka, do Dunaje prostřednictvím Moravy a Dyje Svratka, Oslava, Jihlava, Rokytná, Jevišovka a Moravská Dyje. Na řekách byla vybudována řada menších a několik středně velkých přehrad, sloužících především k regulaci průtoku a jako zásoba pitné vody.
Kraj Vysočina je rozlohou (6 795,7 km2, vymezení k 1. 1. 2005) v ČR krajem nadprůměrné velikosti. Zaujímá 8,62%rozlohy ČR a je pátým největším ze 14 krajů ČR. Naopak počtem obyvatel je krajem menší velikosti. Začátkem roku 2004 žilo v kraji 510,5 tis, obyvatel (vymezení k 1. 1. 2005), což bylo 5,0% obyvatel ČR. Pouze v Pardubickém, Libereckém a Karlovarském kraji žilo méně obyvatel než na Vysočině